(1)

Direktyvos 2003/99/EB 8 straipsnio 2 dalyje reikalaujama, kad atitinkamos valstybės narės kompetentinga institucija, bendradarbiaudama su kompetentingomis institucijomis, atsakingomis už didelių tarpvalstybinio pobūdžio grėsmių žmonių sveikatai ir jų pasekmių šalinimą pagal Europos Parlamento ir Tarybos sprendimą Nr. 2119/98/EB (2), tirtų per maistą plintančius protrūkius. Tas sprendimas buvo panaikintas Europos Parlamento ir Tarybos sprendimu Nr. 1082/2013/ES (3), kuris vėliau buvo panaikintas ir pakeistas Europos Parlamento ir Tarybos reglamentu (ES) 2022/2371 (4). Atliekant šiuos tyrimus turi būti gauti duomenys apie epidemiologinį profilį, galimai susijusius maisto produktus ir galimas protrūkių priežastis, taip pat jie turi apimti atitinkamus epidemiologinius ir mikrobiologinius tyrimus;

(2)

visuomenės sveikatos ir maisto saugos institucijų efektyvumas ir tarpsektorinis bendradarbiavimas atliekant tokius tyrimus yra labai svarbūs siekiant apriboti protrūkio poveikį visuomenės sveikatai ir kuo labiau sumažinti ekonominį poveikį, susijusį su nesaugių ar potencialiai nesaugių maisto produktų atšaukimu ir pašalinimu iš rinkos. Šiuo tikslu būtina greitai ir patikimai identifikuoti partijas ir serijas arba siuntas, kuriose yra užkrėsto maisto produktų, ir nustatyti protrūkio priežastį;

(3)

viso genomo sekoskaita yra modernus molekulinės analizės metodas, taikomas atliekant mikrobiologinius tyrimus, leidžiantis labai greitai identifikuoti mikroorganizmų grupes ir padedantis vykdyti epidemiologinius tyrimus; atliekant protrūkio tyrimą, šis metodas leidžia nustatyti per maistą plintančių patogenų izoliatų, išskirtų iš žmonių, maisto produktų, gyvūnų, pašarų ir susijusios aplinkos, tarpusavio ryšius;

(4)

siekiant iš esmės palengvinti per maistą plintančių ligų protrūkių tyrimus ir laiku nustatyti šių protrūkių šaltinius, turėtų būti reikalaujama, kad valstybės narės iš maisto tvarkymo bei pašarų ūkio subjektų ir vykdydamos oficialią kontrolę rinktų Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, Campylobacter jejuni ir Campylobacter coli izoliatus, išskirtus iš maisto produktų, gyvūnų, pašarų ir susijusios aplinkos mėginių, jei tie izoliatai yra susiję arba įtariama, kad jie susiję su per maistą plintančios ligos protrūkiu. Taip pat turėtų būti reikalaujama, kad valstybės narės atliktų tų izoliatų viso genomo sekoskaitos tyrimą;

(5)

valstybės narės turėtų perduoti šių patogenų izoliatų, išskirtų iš maisto produktų, gyvūnų, pašarų ir susijusios aplinkos, viso genomo sekoskaitos tyrimo rezultatus Europos maisto saugos tarnybai (toliau – Tarnyba), kuri kartu su Europos ligų prevencijos ir kontrolės centru (ECDC) sukūrė bendros sveikatos koncepcija grindžiamą bendrą sistemą. Bendros sveikatos koncepcija grindžiamoje bendroje sistemoje Tarnyba gali palyginti pagal šį reglamentą surinktų šių patogenų izoliatų viso genomo sekoskaitos tyrimo rezultatus su iš žmogaus išskirtų izoliatų viso genomo sekoskaitos tyrimo rezultatais, pateiktais Europos ligų prevencijos ir kontrolės centrui pagal Reglamento (ES) 2022/2371 13 straipsnio 3 dalies d punktą. Toks palyginimas leidžia nustatyti protrūkio šaltinį ir užkrėstas siuntas, kai jis atliekamas kartu naudojant epidemiologinių tyrimų duomenis. Perduodant viso genomo sekoskaitos tyrimo rezultatus EFSA tarnybai, turėtų būti įtraukti papildomi susiję duomenys, kurie yra labai svarbūs per maistą plintančių ligų protrūkių tyrimui;

(6)

tikslinga valstybėms narėms ir Tarnybai suteikti pakankamai laiko prisitaikyti prie naujų reikalavimų, taikomų izoliatų, išskirtų iš maisto produktų, gyvūnų, pašarų ir susijusių aplinkos mėginių, rinkimui, tų izoliatų viso genomo sekoskaitos tyrimui ir susijusių duomenų perdavimui, kad jos galėtų numatyti būtinas technines taikomąsias programas ir finansinius išteklius. Todėl šio reglamento reikalavimai turėtų būti pradėti taikyti praėjus 18 mėnesių nuo šio reglamento įsigaliojimo dienos;

(7)

šiame reglamente nustatytos priemonės atitinka Augalų, gyvūnų, maisto ir pašarų nuolatinio komiteto nuomonę,